O pedido de recuperação judicial da empresa foi deferido em janeiro deste ano pelo juiz Fernando César Rodrigues Salgado, da 2ª Vara Cível, Fazendas Públicas e Registro Público de Rio Verde. O pedido de recuperação foi feito originalmente na 2ª Vara de Falências e Recuperações Judiciais do Fórum João Mendes, em São Paulo, no fim de outubro de 2008. Mas, em dezembro do mesmo ano, os advogados da empresa pediram a redistribuição e o processo foi para Rio Verde, onde está o principal escritório do Margen.
Segundo a Federação da Agricultura e Pecuária de Goiás (Faeg), está sujeita à recuperação judicial uma dívida de R$ 330,958 milhões. Desse total, R$ 13,241 milhões são credores trabalhistas, R$ 251,875 milhões com garantia real e R$ 65,842 milhões, quirografários.
Segundo o presidente da Comissão de Pecuária de Corte da Federação da Agricultura e Pecuária de Goiás (Faeg), José Manoel Caixeta Haun, é muito importante a presença dos credores na assembléia, pois será nesta ocasião que será definido como a empresa efetuará os pagamentos. "A voz do produtor neste caso é o voto", acrescenta.